苗栗縣竹南鎮公所依法辦理自治事項，並執行上級政府委辦事項。鎮長：綜理鎮政，指揮、監督所屬員工及機關。主任秘書：承鎮長之命，處理鎮政。秘書、專員：受主任秘書之指揮、監督，掌理機要、法制、動員、協調、核稿等事項。設下列課、室，分別掌理有關事項：一、民政課：掌理一般行政、自治、地政、調解服務、行政區域、禮俗、宗教、法制國家賠償、原住民行政、兵役行政及協辦民防等事項。二、社會文化課：掌理一般社政、社區發展、社會福利、全民健保及教育文化等事項。三、財政課：掌理財務、公產、公共造產、出納及協助稅捐稽徵等事項。四、建設課：掌理土木工程、都市計畫、公共建設、小型排水設施、交通管理、建築管理、違章建築查報處理、水利工程、公寓大廈管理、工業、商業、公用事業、公營事業、觀光事業及協助工商行政管理等事項。五、農業課：掌理水旱田調整計劃綠肥休耕轉作、農業災害申請、農民購買農機補助申請、農情調查、農業用地作農業使用證明、農業用地容許作農業設施使用同意書、農業經營不可分離用地申請、休閒農業區申請、山坡地水土保持、林產推廣、環境綠美化、畜情調查、畜牧場登記申請等事項、生態保育及環境綠美化等事項。六、行政室：掌理文書、庶務、辦公廳舍、印信、研考、公關、新聞發佈、便民服務及不屬於各單位事項。七、主計室：辦理歲計、會計及統計事項。八、人事室：辦理人事管理事項。九、政風室：辦理政風事項。十、清潔隊：廢棄物清理、環境衛生之管理、車輛維護管理、資源回收、稽查業務、公害防治等業務。十一、圖書館：蒐集、整理、保存各項圖書資料及地方文獻供民眾閱覽等事項；推廣、輔導、宣傳、研習及辦理有關文化活動等事項。十二、幼兒園：兒童保育、衛生保健事項、其他行政管理事項。十三、公有零售市場：市場公共秩序之維持事項、市場環境衛生之維護事項、攤（舖）位承租人違反零售市場管理規則之告發及處理事項、攤（舖）位各項費用之催繳事項、其他有關市場管理及上級交辦事項。十四、公園路燈管理所：公園及公有停車場之管理與維護、設施之修繕保養、環境衛生之管理等事項、路燈之維修管理事項。十五、殯葬管理所:普覺堂及公墓管理等事項。